PWstudio 在命令行提交

本篇适合已经比较熟悉命令行操作、想直接用 slurm 提交计算作业的用户；如果你更习惯用网页上的 Qflow 工作流拖拽界面来提交任务，可以不用看本篇，直接用浏览器操作即可。

1. 登录终端

通过 ssh 终端 (常见的有 xshell, mobaxterm) 登录到容器里, 用 pwmat 登录容器。如果你还不熟悉怎么用这类工具登录、以及怎么上传下载文件，可以先看这份新手教程：MobaXterm 新手教程。

2. 计算案例example01

（1）准备输入文件

* 结构文件 atom.config

atom.config 结构文件是PWmat软件支持的标准结构输入格式，可以通过Q-Studio建模工具构建模型并导出。登录Q-Studio,用 pwmat 登录容器

     2
 LATTICE
      0.00000000     2.71535000     2.71535000
      2.71535000     0.00000000     2.71535000
      2.71535000     2.71535000     0.00000000
 POSITION
  14     0.00000000     0.00000000     0.00000000 0 0 0
  14     0.25000000     0.25000000     0.25000000 0 0 0

* 参数文件 etot.input

除指定输入文件的名称外，不区分大小写；除首行外，其他行不区分顺序。阅读参数手册，https://www.pwmat.com/pwmat-resource/Manual.pdf

1  1
JOB = SCF
IN.PSP1 = Si.SG15.PBE.UPF
IN.ATOM = atom.config
MP_N123 = 9 9 9 0 0 0

* 赝势文件 *UPF

拷贝结构文件中各元素对应的赝势文件，推荐采用SG15模守恒赝势。赝势包可在PWmat的官网https://www.pwmat.com/potential-download 下载

* 脚本文件 slurm.sh

运行PWmat时，需要在PWmat后面加上-host参数，并在-host参数后加上config.json文件中的“IP”和“PORT”值；

通过nvidia-smi命令查看机器上的GPU卡数来配置计算资源

#!/bin/sh
#SBATCH --partition=gpu
#SBATCH --job-name=tutorial_scf
#SBATCH --nodes=1
#SBATCH --ntasks-per-node=1
#SBATCH --gres=gpu:1
#SBATCH --gpus-per-task=1

module load mkl mpi
module load cuda/12.1
module load pwmat/20260428

which PWmat

mpirun -np $SLURM_NPROCS PWmat -host 172.17.0.1 50001 | tee output

以上四个文件（atom.config、etot.input、赝势文件、slurm.sh）准备好之后，需要放在同一个目录下，才能下一步提交。

（2）提交计算

在准备好上面四个文件的目录下，执行：