mstation 龙讯一体机软件调用方法 📄

软件列表

• cuda 11.6

  调用方法

  module load cuda/11.6
  echo $CUDADIR
  

• intel 2013

  调用方法

  module load intel/2013
  which mpirun
  

• intel 2016

  调用方法

  module load intel/2016
  which mpirun
  

• intel 2020

  调用方法

  module load intel/2020
  which mpirun
  

• oneapi 2022.1.2

  调用方法

  module load intel/2020
  which mpirun
  

• openmpi 2.1.0

  调用方法

  module load openmpi/2.1.0
  which mpirun
  

• gcc 7 系列 和 gcc 9 系列

  调用方法

  # 调用 gcc 7
  source /opt/rh/devtoolset-7/enable
  which gcc
  
  # 调用 gcc 9
  source /opt/rh/devtoolset-9/enable
  which g++
  

• conda 2.5.2

  调用方法

  module load conda/2-5.2.0
  source /share/app/conda/conda2/etc/profile.d/conda.sh
  conda activate base
  conda deactivate
  

• conda 3-2020.07

  调用方法

  module load conda/3-2020.07
  source /share/app/conda/conda3/etc/profile.d/conda.sh
  conda activate base
  conda deactivate
  

• fftw 3.3.4

  调用方法

  module load fftw/3.3.4
  echo $PATH | grep fftw
  

• grace 5.1.25

  调用方法

  module load grace/5.1.25
  echo $PATH | grep grace
  

• libint 1.1.4

• [ ] 调用方法

  module load libint/1.1.4
  

• libxc 2.0.1 2.1.2 3.0.0 3.0.1 4.0.2

  调用方法

  module load libxc/2.0.1
  module load libxc/2.1.2
  module load libxc/3.0.1
  module load libxc/3.0.0
  module load libxc/4.0.2
  

• magma 2.5.4

  调用方法

  module load magma/2.5.4
  

• iotk

  调用方法

  module load magma/2.5.4
  

• vmd 1.9.2

  调用方法

  vmd -h
  

• espresso 5.1.2 (QE)

• lammps

  调用方法

  module load mpi/latest
  module load lammps/23Jun2022
  which lmp_mpi
  

• vesta 3.4.2

  调用方法

  VESTA
  

• ovito 2.4.4

  调用方法

  /share/app/ovito-2.4.4-x86_64/bin/ovitos
  
  /share/app/ovito-2.4.4-x86_64/bin/ovito
  

• gpuburn

  调用方法

  module load cuda/11.6 gpuburn
  cd /share/app/gpu-burn-11.1/
  gpu_burn
  

• nmon

  调用方法

  nmon
  

• pwmat 最新版本

  调用方法

  module load compiler/latest mpi/latest mkl/latest
  
  module load cuda/11.6
  module load pwmat/20221031   # 以实际最新版本做相应的修改
  
  which PWmat
  

  slurm 提交脚本 pwmat.slurm

  #!/bin/sh
  #SBATCH --partition=gpu
  #SBATCH --job-name=pwmat
  #SBATCH --nodes=1
  #SBATCH --ntasks-per-node=4
  #SBATCH --gres=gpu:4
  #SBATCH --gpus-per-task=1
  
  module load compiler/latest mpi/latest mkl/latest
  
  module load cuda/11.6
  module load pwmat/20221031   # 以实际最新版本做相应的修改
  
  which PWmat
  
  mpirun -np $SLURM_NPROCS PWmat | tee output
  

pwmat 模块

• ELPWmat

• PyPWmat

  module load conda/2-5.2.0 pypwmat
  which PWmat2Phonopy
  

• MLFF

  调用方法

  module load conda/3-2020.07
  source /share/app/conda/conda3/etc/profile.d/conda.sh
  module load intel/2020
  module load cuda/11.6
  module load MLFF/2022.06.13
  conda activate mlff
  which mlff.py
  conda deactivate
  

其它软件

• deepmd-kit dpdata

  调用方法

  module load conda/3-2020.07
  source /share/app/conda/conda3/etc/profile.d/conda.sh
  conda activate /share/app/deepmd-kit
  which dp lmp
  conda deactivate
  

• dp-gen

  调用方法

  module load conda/3-2020.07
  source /share/app/conda/conda3/etc/profile.d/conda.sh
  conda activate /share/app/dpgen-0.10.6
  which dpgen
  conda deactivate
  

• 其它 python 包: pytorch pymatgen scikit-learn...

  调用方法

  module load conda/3-2020.07
  source /share/app/conda/conda3/etc/profile.d/conda.sh
  conda activate myenv
  conda list
  conda deactivate