http://mcloud-doc.lonxun.com/wiki/ 2026-04-23T01:48:36+00:00 http://mcloud-doc.lonxun.com/wiki/ http://mcloud-doc.lonxun.com/wiki/_media/logo.png text/html 2023-12-29T04:56:05+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://mcloud-doc.lonxun.com/wiki/mcloud/cmd?rev=1703825765&do=diff 常用命令 1. 查看节点信息 sinfo -o '%20N %.6D %.6c %15F %12P %f' sinfo -O 'nodehost,available,cpusstate,cpus,gres,partitionname,reason,cpusload,freemem' text/html 2024-01-25T07:13:18+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://mcloud-doc.lonxun.com/wiki/mcloud/cp2k?rev=1706166798&do=diff mcloud 中 cp2k 使用 mkdir playground cd playground wget https://raw.githubusercontent.com/cp2k/cp2k/master/benchmarks/QS/H2O-32.inp singularity run --bind $PWD/H2O-32.inp:/opt/cp2k/data/H2O-32.inp /share/app/sif/cp2k_latest.sif mpiexec -genv OMP_NUM_THREADS=2 -np 3 cp2k H2O-32.inp text/html 2024-03-04T02:20:22+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://mcloud-doc.lonxun.com/wiki/mcloud/dcu?rev=1709518822&do=diff pwmat 提交脚本 dcu 卡 提交脚本 #!/bin/bash #SBATCH --partition=xadhtest #SBATCH --job-name=pwmat #SBATCH --nodes=1 #SBATCH --gres=dcu:4 #SBATCH --exclusive ulimit -a ulimit -s unlimited ulimit -l unlimited ulimit -a module purge module load pwmat/20240223-magma-DCU2-intelmpi-2021 mpirun -np 4 PWmat -host 10.13.5.14 50001 | tee output text/html 2024-01-18T07:13:50+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://mcloud-doc.lonxun.com/wiki/mcloud/demo?rev=1705562030&do=diff 提交作业模板 提交 lammps 作业 #!/bin/bash #SBATCH --job-name=demo #SBATCH --output=%x_%j.out #SBATCH --error=%x_%j.err #SBATCH --partition=demo #SBATCH --nodes=1 #SBATCH --ntasks-per-node=4 module load intel/2020 module load cuda/11.6 module load lammps-23Jun2022 mpirun -bootstrap slurm -np $SLURM_NPROCS lmp_mpi < in.melt text/html 2024-01-02T06:06:38+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://mcloud-doc.lonxun.com/wiki/mcloud/gcc?rev=1704175598&do=diff mcloud 下高版本 gcc 高版本 gcc 安装在 /opt/rh 下, 有多个版本 使用高版本 gcc 的方法 以 gcc11 为例子 1. 方法一: source /opt/rh/devtoolset-11/enable 2. 方法二: scl enable devtoolset-11 bash 其它命令 gfortran -v gcc --version scl --list scl --help text/html 2025-07-02T05:36:58+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://mcloud-doc.lonxun.com/wiki/mcloud/howto?rev=1751434618&do=diff mcloud 使用指南 mcloud 使用步骤 * 访问: mcloud云平台 * 点击 SHELL 图标, 打开终端 * 编写作业脚本, 如下示例 1 node #!/bin/sh #SBATCH --partition=3080ti #SBATCH --job-name=H2relax #SBATCH --nodes=1 #SBATCH --ntasks-per-node=4 #SBATCH --gres=gpu:4 #SBATCH --gpus-per-task=1 module load compiler mkl mpi module load cuda/11.6 module load pwmat mpirun -np $SLURM_NPROCS PWmat | tee output text/html 2024-03-06T23:30:09+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://mcloud-doc.lonxun.com/wiki/mcloud/mlff?rev=1709767809&do=diff mlff 使用 例子位置 " demo 位置: /share/public/20240306-mlff-test" [pengge@login ~]$ cp -rp /share/public/20240306-mlff-test . [pengge@login ~]$ cd 20240306-mlff-test/lmpsn/ 加载 conda 环境 [pengge@login lmpsn]$ source /share/app/anaconda3/etc/profile.d/conda.sh [pengge@login lmpsn]$ conda activate PWMLFF (PWMLFF) [pengge@login lmpsn]$ text/html 2024-02-04T02:11:33+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://mcloud-doc.lonxun.com/wiki/mcloud/pwkit?rev=1707012693&do=diff pwkit 使用 module load pwkit [pengge@mgt02 ~]$ pwkit _ _ ____ ___ __ ___ __ _| |_ | '_ \ \ /\ / / '_ ` _ \ / _` | __| website: http://www.lonxun.com | |_) \ V V /| | | | | | (_| | |_ v1.0.0 | .__/ \_/\_/ |_| |_| |_|\__,_|\__| PWkit Usage: http://doc.lonxun.com/PWkit/PWkit.html |_| ======================================= Generator ======================================== g) 进入 Input Generator 模块 为 PWmat 生成输入文件。 ==================================… text/html 2025-03-20T03:55:19+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://mcloud-doc.lonxun.com/wiki/mcloud/slurm?rev=1742442919&do=diff slurm 使用 使用环境 用户注册, 登录 mcloud 后: * 测试 slurm 资源调度 srun -p 3080ti --mem=1 --time=1 --gres=gpu:1 hostname sbatch -p 3080ti --mem=1 --time=1 --gres=gpu:1 --output=%j.out --error=%j.err --wrap="hostname" " text/html 2024-04-09T07:49:17+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://mcloud-doc.lonxun.com/wiki/mcloud/start?rev=1712648957&do=diff mcloud 导航 * 如何使用 pwmat cpu 版 和 gpu 版本 * pwmat 提交脚本 dcu 版本 * 常用命令 * 常用提交模板 * pwkit 使用 * mlff 使用 * pwmat 模块 * pypwmat 模块 * uspex 模块 * ase 模块 * raman 模块 * mcloud 中 cp2k 使用 * 高版本 gcc 使用 * slurm 使用