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如何使用 pwmat

  1. 打开终端
  2. 编写作业脚本, 如下示例
#!/bin/sh
#SBATCH --partition=gpu
#SBATCH --job-name=H2relax
#SBATCH --nodes=1
#SBATCH --ntasks-per-node=4
#SBATCH --gres=gpu:4
#SBATCH --gpus-per-task=1
 
module load compiler mkl mpi
module load cuda/11.6
module load pwmat
mpirun -np $SLURM_NPROCS PWmat | tee output

3. 准备作业输入文件 atom.config etot.input, sbatch 提交作业

指定许可目录

#!/bin/bash
#SBATCH --partition=gpu
#SBATCH --job-name=H2relax
#SBATCH --nodes=1
#SBATCH --ntasks-per-node=4
#SBATCH --gres=gpu:4
#SBATCH --gpus-per-task=1
#SBATCH --output=%j.out
#SBATCH --error=%j.err
 
module load compiler mkl mpi
module load cuda/11.6
module load pwmat
 
PWMAT_LICENSE=/share/home/pwmat/PWMAT    # 许可文件: /share/home/pwmat/PWMAT/pwmat.lic
 
mpirun -np $SLURM_NPROCS PWmat -lic-path $PWMAT_LICENSE | tee output

升级 pwmat

pwmat 版本分类

  1. gpu 版本: 指 nvidia 系列 gpu 卡对应的版本, cpu 为 x86_64 架构, linux 系统
  2. cpu 版本: 指 不需要 gpu, 纯用 cpu 进行计算的版本, cpu 为 x86_64 架构, linux 系统
  3. dcu 版本: 指 国产 gpu 卡(海光 HYGON)对应的版本, cpu 为 x86_64 架构, linux 系统
  4. windows 版本: 可以下载到命令行和图形界面2种版本. 不使用 gpu 卡, cpu 为 x86_64 架构, windows 10/11 系统
gpu 版 和 dcu 版又分单机版 和 集群版
主要区别在于:
单机版: 通过 pwmat.lic 许可文件授权
集群版: 通过 pwmat.lic 许可文件授权 或 通过 服务 来授权
cpu 版本只能通过 服务 来授权

找到要升级的 pwmat 版本

目前 pwmat 最常用的版本是 gpu 版. 通过授权的方法可以确定是单机版还是集群版

要升级还需要确定 pwmat 使用的 cuda 版本 和 mpi 版本分类

在提交脚本中, mpirun 之前加上如下几行 

which nvcc
nvcc --version
which mpirun
which PWmat
nvidia-smi -L