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====== mcloud 中 cp2k 使用 ======

<code bash>
mkdir playground
cd playground

wget https://raw.githubusercontent.com/cp2k/cp2k/master/benchmarks/QS/H2O-32.inp

singularity run --bind $PWD/H2O-32.inp:/opt/cp2k/data/H2O-32.inp /share/app/sif/cp2k_latest.sif mpiexec -genv OMP_NUM_THREADS=2 -np 3 cp2k H2O-32.inp
</code>

提交脚本 

<code bash>
#!/bin/bash
 
#SBATCH --partition=cpu
#SBATCH --job-name=RPA
#SBATCH --nodes=1
#SBATCH --ntasks-per-node=2
#SBATCH --cpus-per-task=32
#SBATCH --output=%j.out
#SBATCH --error=%j.err

export OMP_NUM_THREADS=$SLURM_CPUS_PER_TASK

module load mpi

mpirun -n $SLURM_NTASKS singularity exec --bind /data/home/pengge/playground/H2O-32.inp:/opt/cp2k/data/H2O-32.inp /share/app/sif/cp2k_latest.sif cp2k H2O-32.inp
</code>

singularity run mpiexec -np 与 mpirun -np singularity exec的区别
   singularity run mpiexec -np不结合调度器，在单机中使用 singularity 运行作业，完全使用容器内部的 mpi 和软件。该方式可以不
   需要在主机上安装 mpi，但无法多节点运行
   mpirun -np singularity exec结合外部调度器和 mpi 在 singularity 中运行作业，结合主机上和容器内部的 mpi，可以实现跨节点的
   容器作业调度。此种方式可以适用调度器进行调度，也可跨节点运行。用slurm进行作业提交时，将该命令放到提交脚本中
   ref:
   [1] https://docsv4.qingcloud.com/user_guide/compute/hpc/best-practices/sample3/
   [2] https://docs.sylabs.io/guides/3.6/user-guide/mpi.html